Record in detail


General Info

  • lamp_id:L01A000405
  • Name:Ruminococcin-A
  • FullName:Ruminococcin-A
  • Source:Ruminococcus gnavus
  • Mass:2439.8 Da
  • Sequence Length:21 aa
  • Isoelectric Point:7.37
  • Activity:Antibacterial
  • Sequence
        GNGVLKTISHECNMNTWQFLF
  • Function:

Cross-Linking

Top similar AMPs

  • Top similar AMPs on LAMP
  • 1. L12A09160|    From 24 To 44 E-value: 0.00000005 Score: 48.1
        GNGVLKTISHECNMNTWQFLF
  • 2. L12A09161|    From 24 To 44 E-value: 0.00000005 Score: 47.8
        GNGVLKTISHECNMNTWQFLF
  • 3. L01A000405    From 1 To 21 E-value: 0.00000007 Score: 47.4
        GNGVLKTISHECNMNTWQFLF
  • 4. L01A002448    From 1 To 21 E-value: 0.00000008 Score: 47.4
        GNGVLKTISHECNMNTWQFLF
  • 5. L12A03898|    From 1 To 21 E-value: 0.0000006 Score: 44.3
        GNGVIKTVSHECKMNTWQFLF

Structure

  •   Domains

    •     No domains found on LAMP database
  •   Structures

        No structs found on LAMP database

Activity

  •   Antibacterial Activities
  •   1  Target:  Bacteroides vulgatus ATCC 8482  MIC:  600 μg/ml  (245.922 μM)  
  •   2  Target:  Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703  MIC:  150 μg/ml  (61.4804 μM)  
  •   3  Target:  Bifidobacterium breve ATCC 15700  MIC:  300 μg/ml  (122.961 μM)  
  •   4  Target:  Bifidobacterium catenulatum ATCC 27539  MIC:  150 μg/ml  (61.4804 μM)  
  •   5  Target:  B. longum ATCC 15707  MIC:  75 μg/ml  (30.7402 μM)  
  •   6  Target:  Eubacterium contortum ATCC 25540  MIC:  32.5 μg/ml  (13.3208 μM)  
  •   7  Target:  Ruminococcus obeum ATCC 29174  MIC:  32.5 μg/ml  (13.3208 μM)  
  •   8  Target:  R. torques ATCC 27756  MIC:  300 μg/ml  (122.961 μM)  
  •   9  Target:  R. gnavus ATCC 29149  MIC:  75 μg/ml  (30.7402 μM)  
  •   10  Target:  C. nexile ATCC 27757  MIC:  150 μg/ml  (61.4804 μM)  
  •   11  Target:  C. oroticum ATCC 13619  MIC:  600 μg/ml  (245.922 μM)  
  •   12  Target:  C. perfringens CpA  MIC:  75 μg/ml  (30.7402 μM)  
  •   13  Target:  C. difficile serogroup A B-1  MIC:  75 μg/ml  (30.7402 μM)  
  •   14  Target:  C. difficile serogroup C C253  MIC:  75 μg/ml  (30.7402 μM)  
  •   15  Target:  C. difficile serogroup D ATCC 43598  MIC:  150 μg/ml  (61.4804 μM)  
  •   16  Target:  C. difficile serogroup F M-1  MIC:  150 μg/ml  (61.4804 μM)  
  •   17  Target:  C. difficile serogroup S3 79685  MIC:  75 μg/ml  (30.7402 μM)  
  •   18  Target:  C. difficile ATCC 43255  MIC:  150 μg/ml  (61.4804 μM)  
  •   19  Target:  C. botulinum type A CIP 38  MIC:  75 μg/ml  (30.7402 μM)  
  •   20  Target:  C. botulinum type BNCTC 7273  MIC:  75 μg/ml  (30.7402 μM)  
  •   21  Target:  C. botulinum type E NCTC 8266  MIC:  75 μg/ml  (30.7402 μM)  
  •   22  Target:  C. sordellii VPI 9048  MIC:  150 μg/ml  (61.4804 μM)  
  •   23  Target:  C. bifermentans NCTC 506  MIC:  75 μg/ml  (30.7402 μM)  
  •   24  Target:  C. septicum ATCC 12464  MIC:  150 μg/ml  (61.4804 μM)  
  •   25  Target:  C. sporogenes ATCC 19404  MIC:  300 μg/ml  (122.961 μM)  
  •   26  Target:  B. cereus Z4222 B. cereus TZ415  MIC:  75 μg/ml  (30.7402 μM)  
  •   27  Target:  B. cereus Z4234 B. cereus K1231 B. cereus P2101  MIC:  150 μg/ml  (61.4804 μM)  

Toxicity

  •   Toxicity

    •     No toxicity records found on LAMP database

Reference

  •   Reference

    •     No references found on LAMP database

Comments

  •   Comments

    •     No comments found on LAMP database



CAPTCHA Image   Reload Image
Enter Code*: